Outros tipos de HPV têm sido associados a câncer dos órgãos genitais tanto em homens como em mulheres. Esses tipos são chamados de "alto risco" porque podem causar a doença Além disso, provocam mudanças de baixo grau e alto grau nas células cervicais assim como condições pré-cancerígenas. Os médicos estão mais preocupados com as mudanças de alto grau e os pré-cânceres uma vez que estas tendem a se transformar em câncer com o tempo.

Os tipos de HPV de alto risco mais comuns incluem:

• HPV-16.
• HPV-18.
• HPV-31.
• HPV-35.
• HPV-39.
• HPV-45.
• HPV-51.
• HPV-52.
• HPV-58.

O HPV genital é um vírus comum. Alguns médicos acreditam que este vírus é quase tão comum quanto o vírus do resfriado.

O HPV genital é especialmente comum entre jovens. Um estudo realizado em 2011 indicou que 45% das mulheres entre 20 e 24 anos tinham um alto risco de HPV. Além disso, entre os jovens de 14 a 19 anos, 25% tiveram um alto risco de HPV. Não há teste de HPV para os homens, embora estudos mostrem que 1 em cada 3 homens (com 18 anos ou mais) são positivos para os tipos de HPV de alto risco.